第五部是故事容量最饱满的一部,也是全书最高潮。以吕不韦于咸阳四门张挂《吕氏春秋》,公然悬赏改一字赐千金拉开序幕,李斯、蒙恬与吕不韦门客城下论战,公开驳斥《吕氏春秋》,引发朝野大论争;秦王政以坏法乱政,蛊惑国人之罪罢黜吕不韦,吕不韦被迫自杀于雒阳。此后正式拉开帝国创建大幕,展开四大阶段故事:第一阶段整肃军政,超拔新锐,一大批年轻将领与主政大臣形成新生代势力,同时大力建设秦国腹地的水利工程郑国渠,使秦川成天府之国;第二阶段展开统一中国的连绵大战,展开六国逐一灭亡的故事;第三阶段 ,统一架构华夏文明体系,发动彻底驱赶匈奴的阴山大战,建立万里长城与其他大型工程;第四阶段秦始皇勤政巡视天下,积劳成疾而依赖方士奇术救治,深感人生苦短,遂生求仙长生之心,第六次巡视时突然病重,死于巡狩途中(沙丘)。秦国出现巨大的权力真空,野心与阴谋蠢蠢欲动,引出第六部。